BepiColombo est constitué de deux sondes différentes pour remplir tous ses objectifs scientifiques.

La sonde MPO

MPO est une sonde stabilisée trois-axes en orbite basse polaire faiblement elliptique dont le périherme sera à l'altitude de 480 km et l'apoherme à 1500 km. Elle a été développée sous la responsabilité de l'ESA.

Caractéristiques de la sonde :
Masse totale : 400 kg
Masse de la charge utile : 60 kg

La sonde Mio

Mio est une sonde en stabilisation spinnée qui sera placée en orbite elliptique polaire dont le périherme sera à l'altitude de 600 km et l'apoherme à 11800 km. Elle a été développée sous la responsabilité de la JAXA.

Caractéristiques de la sonde :
Masse totale : 220 kg
Masse de la charge utile : 40 kg

Instruments de la sonde MPO

Pour étudier la surface, l'intérieur, l'exosphère et la magnétosphère de Mercure, la charge utile de l'orbiteur MPO est constituée de :

• Un ensemble d'imageurs (SIMBIO-SYS) comprenant : une caméra haute résolution, une caméra stéréo et un spectromètre visible proche infrarouge (VIHI) ;
• Un spectromètre et radiomètre infrarouge thermique (MERTIS) ;
• Un altimètre laser (BELA) ;
• Un spectromètre UV (PHEBUS) ;
• Deux spectromètres rayons X et détecteur de particule solaire (MIXS et SIXS) ;
• Un spectromètre à neutrons et rayons gamma (MGNS) ;
• Un magnétomètre (MERMAG) ;
• Un analyseur de particules neutres et ionisées (SERENA) ;
• Une expérience radio science et un accéléromètre (MORE et ISA).

Les allocations de cette charge utile sont : une masse limitée à 60 Kg et une puissance de 100W.

Instruments de la sonde Mio

La charge utile de l'orbiteur Mio est constituée d'un ensemble d'instruments et de sous-ensembles d’instruments de mesure du plasma, des champs et des particules, destinés à étudier les processus qui couplent le vent solaire, la magnétosphère et la surface de la planète Mercure. 

Les allocations de cette charge utile sont une masse limitée à 40 Kg et une puissance de 53 W.

Ensemble instrumental pour les mesures de particules chargées (MPPE, Mercury Plasma Particule Experiment)

Cet ensemble est constitué de :

• Deux analyseurs d’électrons : MEA (Mercury Electron Analyzers)
• Un spectromètre de masse : MSA (Mercury mass Spectrum Analyzer)
• Un analyseur de vent solaire : MIA (Mercury Ion Analyzer)
• Un instrument pour les électrons à haute énergie : HEP-e (High Energy Particle instrument for electrons)
• Un instrument pour les ions à haute énergie : HEP-i (High Energy Particle instrument for ions)
• Un analyseur d'atomes neutres énergétiques : ENA (Energetic Neutrals Analyzer) 

MGF (Magnetic Field Sensor)

Il s’agit de deux capteurs trois axes de champ magnétique.

Ensemble instrumental de mesures d'ondes plasma (PWI, Plasma Wave Investigation)

Cet ensemble constitué de :

• Deux antennes dipôles : WPanT (Wire Probe Antenna)
• Une antenne double sonde : MEFISTO (Mercury Electric Field In Situ Tool)
• Un analyseur de champ électrique : EWO
• Un capteur de mesure des composantes du champ magnétique suivant 3 axes : SC (Search Coil sensor)
• Un instrument de mesure active du plasma : AM²P (Active Measurement of Mercury's Plasma)
• Un spectromètre de mesures d'ondes radio et de bruit électrostatique thermique : SORBET (Spectroscopie Ondes Radio and Bruit Electrostatique Thermique) 
   

MDM (Mercury Dust Monitor)

Il s’agit d’un détecteur de poussières.
 

MSASI (Mercury Sodium Atmosphere Imager)

Il s’agit d’un spectromètre imageur de l'exosphère.